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Von DesignTekErhältlich mit dem neuen 7-Gang-Doppelkupplungsgetriebe (PDK) von Porsche, serienmäßig jedoch mit einem neuen 6-Gang-Schaltgetriebe. Der Einsatz von DFI im Boxster S steigerte die Leistung des 3,4-Liter-Motors von 295 PS (220 kW) auf 310 PS (231 kW).
Zu den optischen Änderungen am Boxster S 2009 gehörten neue Scheinwerfer und Rückleuchten, größere vordere Lufteinlässe mit integrierten Tagfahrleuchten und ein verändertes unteres Heck, das von zwei Diffusoren flankiert wird. Der Innenraum umfasste optional das neu gestaltete Porsche Communication Management System mit einer Touchscreen-Oberfläche, um die Anzahl der Tasten zu reduzieren.